Klintehamn är bra ställplats om man ska till Stora Karlsö
Klintehamn har gamla anor som fiskeläge och hamn, och redan under 1600-talet var den en viktig exporthamn, främst för kalk, tjära och trävaror. Från 1649 fanns en strandridare stationerad i Klintehamn. Handeln i Klintehamn dominerades under andra hälften av 1700-talet handelshuset Donner. Jakob Niklas Donner köpte på 1770-talet Donnerska huset i Klintehamn och lät 1782 anlägga ett skeppsvarv och en vinterhamn på Varvsholmen. 1828 befriades hamnen i Klintehamn från kravet att klarera utrikesgående fartyg i Visby före avfärd, vilket medförde ett uppsving för handeln. Samtidigt blev det även tillåtet att bedriva bodhandel i Klintehamn. Fram till 1860-talet skedde också all posttrafik mellan Gotland och fastlandet över Klintehamn, i äldre tid främst med postjakter mellan Klintehamn och Böda på Öland.